Historia completa
Polonia, 1944. En un campo de concentración, el niño Erik Lehnsherr es separado de sus padres y dobla una reja de hierro solo con la mente. Décadas después, en un futuro cercano, los mutantes están en el centro del debate político. El senador Robert Kelly quiere una ley que obligue a todos a registrarse. El Profesor Charles Xavier cree que se puede vivir en paz. Erik, ahora Magneto, cree que no.
En el norte de Canadá, la adolescente Marie descubre su poder de la peor manera: al besar a su novio, le absorbe la energía y lo deja en coma. Huye, adopta el nombre de Pícara y se sube al camión de Logan, Wolverine, un peleador de bar con garras de metal, factor de curación y ningún recuerdo de su pasado. Dientes de Sable los ataca en la carretera, y Cíclope y Tormenta los rescatan y los llevan a la escuela de Xavier, en Nueva York.
Logan conoce la mansión, a los alumnos y a los X-Men: Cíclope, Jean Grey y Tormenta. Choca de frente con Cíclope y se fija en Jean. La Hermandad de Magneto, con Mística, Sapo y Dientes de Sable, secuestra al senador Kelly y lo usa como conejillo de una máquina que convierte humanos en mutantes. Kelly escapa, pero su cuerpo no aguanta la mutación y se deshace en agua. Mística se infiltra en la escuela, asusta a Pícara y la hace huir. Magneto la atrapa en una estación de tren. Era a ella a quien quería todo el tiempo.
El plan es usar la máquina en Ellis Island, donde se reúnen líderes de todo el mundo. El aparato gasta tanta energía que mataría a Magneto, así que piensa pasarle su poder a Pícara y dejar que ella muera en su lugar. Mística sabotea Cerebro y Xavier queda en coma. Jean repara el equipo y ubica la máquina en lo alto de la Estatua de la Libertad.
Los X-Men toman la estatua. Tormenta fulmina a Sapo con un rayo, Wolverine pelea con Mística y con Dientes de Sable, y Cíclope derriba a Magneto con una ráfaga. Logan destruye la máquina y toca a Pícara, que se está muriendo, para que absorba su factor de curación. Los dos sobreviven. Xavier despierta y visita a Magneto en una prisión hecha toda de plástico, donde juegan ajedrez y prometen seguir la pelea. El senador Kelly aparece en televisión, pero es Mística disfrazada. Logan se va al norte, a una base en Alkali Lake, en busca de pistas de su pasado.