Resumo para lembrar
Meio ano depois, Red e Blue voltam a Pallet Town e são atacados por uma sombra misteriosa, que depois se revela Deoxys. Green está prestes a reencontrar os pais quando um buraco negro os engole, e ela cai de um barco. Os três vão para as Ilhas Sevii, onde treinam para o confronto. A Equipe Rocket sequestra o Professor Oak, e os Três Bestas, Sird, Carr e Orm, espalham o caos pelas ilhas. Giovanni captura Deoxys, e Mewtwo se junta a Red numa luta contra os dois no dirigível da Rocket. Lorelei ajuda os heróis, e Silver, que procura a própria origem, descobre que Giovanni é seu pai. No fim, Red, Green, Blue, Yellow e Silver são transformados em pedra.
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