O traidor dentro da IMF
Ethan é o homem de frente da equipe de Jim Phelps numa missão em Praga para proteger a lista NOC, com os nomes dos agentes infiltrados da CIA. Tudo dá errado: a equipe é morta, Phelps parece cair de uma ponte e Ethan sobra como único sobrevivente. Eugene Kittridge, da IMF, conta que a operação era uma armadilha para achar um traidor, e o suspeito agora é ele. Ethan escapa explodindo o aquário de um restaurante.
Fugitivo, ele se une a Claire, mulher de Phelps, e a dois agentes renegados, o hacker Luther Stickell e Franz Krieger, para roubar a lista verdadeira de dentro da sede da CIA, em Langley. Uma Bíblia de hotel e a referência "Jó 3:14" fazem Ethan entender que o traidor é o próprio Phelps, vivo. No trem rápido para Paris, ele desmascara o mentor diante de Kittridge. Phelps mata Claire e foge de helicóptero, mas Ethan prende o cabo ao trem e o arrasta para dentro do Eurotúnel. No fim, ele e Luther são reintegrados.