História completa
Em 1845, no Canadá, o menino James Howlett vê o pai ser morto pelo caseiro Thomas Logan. Os ossos saem das mãos dele em forma de garras e ele mata o homem, que antes de morrer conta ser seu pai verdadeiro. James foge com Victor Creed, o meio-irmão, que também tem fator de cura e instinto de fera. Os dois atravessam mais de um século de guerras lado a lado: Guerra Civil americana, as duas guerras mundiais e o Vietnã.
No Vietnã, Victor passa do limite e os dois são fuzilados, sem efeito nenhum. O major William Stryker os recruta para a Equipe X, um time de mutantes com Agente Zero, Wade Wilson, John Wraith, Fred Dukes e Chris Bradley. Numa missão na Nigéria, o grupo massacra uma aldeia atrás de um meteorito, e Logan larga tudo. Seis anos depois, ele trabalha como lenhador no Canadá e vive com a professora Kayla Silverfox.
Stryker reaparece dizendo que alguém está matando a velha equipe. Logo depois Logan encontra Kayla morta e acha que foi Victor. Os irmãos brigam e Logan apanha. Para ter força para a vingança, ele aceita o projeto Arma X: o esqueleto recebe adamantium, um metal indestrutível. Antes de terem a memória dele apagada, Logan foge, se esconde numa fazenda e vê os donos serem mortos por Zero. Logan mata Zero e vai atrás de respostas com Wraith, Dukes e o ladrão Remy LeBeau, o Gambit.
A verdade aparece na Ilha de Three Mile, onde Stryker mantém mutantes presos. Kayla está viva. Ela fingiu a morte porque Stryker prendeu a irmã dela. Victor também foi enganado e ficou sem o adamantium prometido. Stryker juntou os poderes dos mutantes capturados em Wade Wilson, agora a Arma XI, que tem lâminas nos braços e a boca costurada. Kayla e Logan libertam os jovens presos, entre eles Scott Summers, e o Professor Xavier aparece para levá-los.
Logan e Victor lutam juntos contra a Arma XI no alto de uma torre de resfriamento. Logan corta a cabeça dele e a torre desaba. Victor some, e Gambit ajuda Logan a sair. Stryker atira balas de adamantium na cabeça de Logan, que sobrevive mas perde toda a memória. Kayla morre dos ferimentos, e Logan vai embora sem lembrar quem ela era. Nas cenas pós-créditos, Stryker é preso pela morte de um general, Logan bebe num bar no Japão e a mão da Arma XI se mexe nos escombros.