Historia completa
What If...? es una antología: cada episodio muestra un universo donde algo pasó distinto, siempre narrado por el Vigilante, un ser cósmico que observa el multiverso sin poder intervenir. La segunda temporada trae historias sueltas, como Nebula uniéndose a los Nova Corps, Peter Quill criado por Ego atacando la Tierra, Happy Hogan convertido en monstruo en Navidad, Tony Stark atrapado en Sakaar y Hela llegando a la China antigua junto a Xu Wenwu. También presenta a Kahhori, una joven mohawk que obtiene poderes del Teseracto y expulsa a los conquistadores españoles de las tierras de su pueblo.
El hilo que une la temporada es la Capitana Carter. Después de enfrentar a un Steve Rogers controlado por el Cuarto Rojo, Peggy Carter es llevada por el Vigilante a otros mundos, como un universo al estilo del siglo XVII. Al final, descubre que Strange Supremo, el Doctor Strange que destruyó su propio universo, está secuestrando gente de otras realidades para intentar reconstruir lo que perdió. Carter, Kahhori y otras variantes se unen y lo enfrentan. Strange Supremo termina aceptando su error y libera a los prisioneros.
La tercera y última temporada trae otro lote de historias: Bruce Banner creando un monstruo gigante al que enfrentan Vengadores en robots, Agatha Harkness en el Hollywood de los años treinta, el Guardián Rojo salvando a los Stark del Soldado del Invierno, la boda de Howard el Pato con Darcy Lewis y el nacimiento de su hija, Byrdie, además de un western con Shang-Chi y Kate Bishop. A lo largo de esos episodios, el Vigilante interviene cada vez más para salvar vidas.
Eso llama la atención de otros tres Vigilantes, liderados por la Eminencia. Llevan al Vigilante a juicio por romper su juramento, y sus intervenciones empiezan a quebrar el multiverso. La Capitana Carter arma un equipo con Kahhori, Byrdie y Tormenta para rescatarlo, con la ayuda inesperada de Ultron Infinito, que muere ganando tiempo para el grupo. Los tres Vigilantes se fusionan en un ser gigante y Carter se lanza contra él. Su golpe separa a los enemigos y lleva a todos al universo de Strange Supremo, el único lugar donde los Vigilantes pierden sus poderes.
Carter desaparece en el proceso y solo queda su escudo roto. El Vigilante convence a la Eminencia de observar con curiosidad y respeto, no con frialdad. Kahhori, Byrdie y Tormenta hacen el juramento y se vuelven nuevas Vigilantes a su lado. La serie termina con el Vigilante más humano que nunca, de luto por Carter, y con el destino de ella sin respuesta.