Historia completa
Dos años después de la primera película, Deadpool se volvió un asesino a sueldo internacional que solo mata a gente mala. En su aniversario con Vanessa deja escapar a un objetivo. Esa noche, Wade y Vanessa deciden tener un hijo. Minutos después, el criminal irrumpe en el departamento buscando a Wade y mata a Vanessa. Wade se venga, pero queda destrozado.
Seis semanas después intenta suicidarse haciéndose explotar. Como siempre, se regenera. Coloso junta los pedazos y lo lleva a la mansión de los X-Men, donde Wade se vuelve aprendiz. En su primera misión, un orfanato llamado Essex rodeado por la policía, conoce a Russell, un chico mutante que lanza fuego por las manos y dice que el director lo maltrata. Wade se da cuenta de que es cierto, mata a un empleado, y los dos terminan en la Nevera, una prisión de mutantes con collares que bloquean los poderes.
Del futuro llega Cable, un soldado con brazo biónico. En su época, Russell se convierte en un asesino que mata a la esposa y a la hija de Cable, y él volvió para matar al chico antes. Cable irrumpe en la prisión, pero Wade se interpone. En la pelea, Wade sale despedido, y Russell, dolido con él, se acerca a otro preso, Juggernaut. Para salvar al chico, Wade arma la X-Force con un aviso de empleo. En el salto en paracaídas para atacar el convoy de la prisión, casi todos mueren de maneras ridículas. Solo quedan Wade y Domino, cuya suerte absurda lo resuelve todo. Russell libera a Juggernaut y ambos huyen al orfanato para matar al director.
Cable propone una tregua: Wade tiene una oportunidad para convencer al chico. Si falla, Cable dispara. En el orfanato, Juggernaut los vence a todos hasta que llega Coloso y lo derriba. Cable dispara contra Russell, y Wade, con un collar que bloquea su curación, se lanza frente a la bala. Muriendo, le dice a Russell que todavía puede ser alguien bueno. El chico desiste de matar al director, y el futuro de Cable cambia.
Cable usa la última carga de su máquina del tiempo para volver unos segundos y pone la ficha que Vanessa le dio a Wade justo donde pega la bala. Wade sobrevive. Dopinder, el taxista, atropella al director del orfanato. Cable decide quedarse en el presente, sabiendo que su familia estará a salvo en el futuro. En las escenas poscréditos, Negasonic y Yukio reparan la máquina, y Wade viaja en el tiempo para salvar a Vanessa y a su compañero Peter, además de corregir algunas vergüenzas de su propia carrera.