O Doutor
Em G.I. Joe: The Rise of Cobra, ele aparece como o Doutor, um cientista mascarado que ajuda James McCullen a criar um exército com nanorrobôs. Na base do Ártico, Duke descobre quem ele é: Rex Lewis, irmão da Baronesa, dado como morto num bombardeio durante uma missão comandada por Duke.
Deformado pela explosão, Rex encontrou a pesquisa de nanorrobôs do Doutor Mindbender e implantou as máquinas na irmã, que virou a Baronesa sob o controle dele. Quando a base é destruída, ele assume o nome de Comandante Cobra, usa nanorrobôs para curar o rosto queimado de McCullen e o põe sob seu controle. Os Joes prendem os dois. A máscara foi redesenhada porque a dos gibis lembrava a Ku Klux Klan.