História completa
Depois de uma rápida passagem por outro universo, Eddie Brock e Venom voltam ao mundo deles e vão parar bêbados num bar no México. O problema é que agora são procurados: Eddie virou o principal suspeito da suposta morte do detetive Patrick Mulligan. A ideia é ir a Nova York limpar o nome. Na briga com uns capangas, um pedaço de Venom fica para trás no bar.
Longe dali, Mulligan está vivo. O general Rex Strickland comanda o Imperium, um programa secreto na Área 51 que captura simbiontes caídos na Terra. As cientistas Teddy Paine e Sadie Christmas estudam os aliens e acreditam que eles podem ajudar a humanidade. Enquanto isso, no planeta onde os simbiontes nasceram, Knull, o criador deles, segue preso e manda os Xenófagos, monstros caçadores, atrás de uma coisa chamada Códex.
Num voo para Nova York, um Xenófago ataca o avião e Eddie e Venom caem no deserto de Nevada. Venom conta a verdade: quando ele ressuscitou Eddie no passado, criou o Códex, a chave que pode libertar Knull. O Códex só some se Eddie ou Venom morrer. Daí em diante, os dois precisam evitar se transformar, porque cada vez que Venom aparece o sinal chama os monstros. A viagem segue de carona com uma família hippie fã de alienígenas, liderada por Martin Moon, que sonha ver a Área 51. Em Las Vegas, Eddie reencontra a Sra. Chen, que dança com Venom num quarto de hotel.
O Xenófago e os soldados de Strickland alcançam os dois na estrada. Eddie e Venom são separados e levados à Área 51. Lá, Sadie liberta Venom, que se junta de novo a Eddie bem a tempo, depois que Strickland atira nele. A nova transformação atrai mais monstros. Mulligan, ligado a um simbionte, é devorado. Venom solta os simbiontes presos na base, e eles se unem aos cientistas para lutar contra a invasão.
Os Xenófagos não param de chegar, e Venom entende que só existe uma saída: morrer para destruir o Códex. Ele se despede de Eddie, se espalha sobre os monstros e se joga num tanque de ácido. Strickland, ferido, muda de lado e explode granadas para acabar com os que restaram. Eddie acorda num hospital, com a ficha limpa em troca de silêncio, e vai sozinho à Estátua da Liberdade, como Venom sempre quis. Na cena dos créditos, Knull avisa que o universo não está mais seguro. Na cena final, o barman do México sai das ruínas da base, e uma barata passa perto de um frasco quebrado com restos de Venom.