Resumen para recordar
La guerra continúa en 49 episodios, más sueltos, muchos dedicados a un personaje o grupo. Carly, la novia de Spike, se suma al elenco humano. La serie profundiza en el pasado de Cybertron: muestra a Optimus antes de la guerra, cuando todavía era Orion Pax, y presenta al sabio Alpha Trion y a las primeras Transformers mujeres. En “Dinobot Island” llegan varios personajes de la línea de 1985, como Omega Supreme, Astrotrain y Blitzwing. Skyfire desaparece al principio. Cerca del final debutan los equipos que se combinan en robots gigantes: Aerialbots, Stunticons, Protectobots y Combaticons. La temporada termina en enero de 1986 sin cerrar la guerra. La historia siguiente salta 20 años, a la película ambientada en 2005.

